Dans la saison 13, l'Agence a été rachetée par le conglomérat d'espionnage connu sous le nom d'IIA (International Intelligence Agency). Alors qu'Archer et sa bande peinent à trouver leur identité en accomplissant d'étranges missions pour Fabian, une question se pose : parviendront-ils à conserver leur indépendance ou succomberont-ils à leurs maîtres corporatifs ?