Van de tropische stranden van Thailand tot de torenhoge toppen van de Zwitserse Alpen, Strike Back: Legacy stort Sectie 20 op een missie van ongekende omvang. In dit seizoen nemen Scott en Stonebridge het op tegen de door de staat gesteunde criminele tak van het Noord-Koreaanse regime, bekend als Office 39. Gecoördineerd door de mooie en toegewijde Noord-Koreaanse agente Han Li-na, diep ingebed in het Britse establishment, assembleert zij in het geheim intercontinentale ballistische raketten die Washington en Londen kunnen vernietigen. Het stoppen van de dreiging van Noord-Korea wordt Sectie 20 fataal wanneer Sir Charles Ridley, een hooggeplaatst figuur binnen Whitehall, in een poging de escalerende wereldwijde spanningen te verminderen, een deal sluit met Noord-Korea om Sectie 20 uit te schakelen.