Ran, Sonoko e Masumi rinvengono il corpo di un uomo deceduto apparentemente per cause naturali. Tuttavia, la presenza del kanji "morte" tracciato col sangue accanto alla vittima suggerisce un inquietante caso di omicidio. Ran rievoca un vecchio mistero irrisolto di cui le aveva parlato Shinichi, in cui Yusaku Kudo aveva concluso che un delitto simile fosse in realtà una messinscena. Per chiarire il mistero, le ragazze contattano Shinichi, che le indirizza verso la villa di famiglia per recuperare una vecchia fotografia del caso paterno. Proprio all'interno dell'abitazione dei Kudo avviene il primo, teso incontro faccia a faccia tra Masumi Sera e Subaru Okiya, mentre Conan cerca di monitorare la situazione a distanza per evitare che la sua copertura salti.