Kogoro viene ingaggiato dal direttore di un avanzato laboratorio di robotica per individuare una spia industriale. Proprio all'inizio dell'appostamento, un improvviso allarme per fuga di gas getta la struttura nel caos. Durante l'ispezione delle sale, Kogoro rinviene il cadavere di un ricercatore, ucciso da un letale squarcio alla gola. Conan esamina i progetti della vittima e scopre che lo scienziato aveva segretamente creato un minuscolo robot dalle sembianze di un topo; grazie a questo sofisticato automa, l'uomo era riuscito a filmare l'identità della talpa che sottraeva i dati riservati. Il piccolo detective deve ora recuperare il dispositivo robotico e le sue registrazioni per smascherare l'assassino prima che riesca a distruggere la prova definitiva del suo tradimento.