Conan analizza la sorprendente somiglianza tra la misteriosa Mary e Ai Haibara, ipotizzando l'esistenza di un legame di parentela che coinvolgerebbe anche Shuichi Akai, data la passata relazione tra quest'ultimo e Akemi Miyano. Mentre il piccolo detective riflette su questi intrecci familiari, Kogoro viene ingaggiato per indagare su un presunto avvistamento UFO. Il caso riguarda il ritrovamento di due uomini immersi nel calcestruzzo fresco: uno dei due è deceduto, mentre il superstite sostiene con fermezza che l'aggressione sia opera di un essere extraterrestre giunto a bordo di un oggetto non identificato. Conan inizia a esaminare la scena del crimine, convinto che dietro la spiegazione fantascientifica si celi un ingegnoso metodo per occultare un omicidio premeditato.